La création de l’Université de Ségou s’inscrit dans la mise en œuvre d’une des recommandations du forum national sur l’éducation initié par le Gouvernement du Mali en octobre –novembre 2008 et qui est relative à l’ouverture de Pôles Universitaires Régionaux.
En effet, ce forum, initié par le Gouvernement du Mali et qui avait pour objectif « d’organiser les concertations régionales et les ateliers selon les modalités qui permettent à chaque acteur et partenaire de l’école malienne, d’apporter sa contribution à l’édification d’un système éducatif national répondant aux besoins » a recommandé entre autres:

• l’ouverture de Pôles Universitaires Régionaux ;
• la création au niveau de l’enseignement supérieur des filières technologiques correspondant aux besoins réels de développement du pays. La priorité devrait porter sur les filières courtes professionnalisantes et la culture de l’entreprenariat ;
• le développement d’un partenariat entre les établissements d’enseignement et les entreprises de la place ;
• la diffusion de l’information autour des filières scientifiques et technologiques au niveau
• des médias afin de faciliter l’orientation de nombreux jeunes vers ces filières.

La déconcentration/décentralisation des structures universitaires fait ainsi partie des dix orientations principales envisagées pour la période 2007-2015.C’est un élément essentiel pour une gestion plus rationnelle des flux qui constituent à tout égard l’une des
problématiques les plus importantes du système de l’enseignement supérieur au Mali. Au terme des études spécifiques menées dans le cadre du PISE II, il a été retenu la création d’une université à Ségou. Pour concrétiser cette décision, une Mission Universitaire a été créée par Décret n°09-128/PM-RM du 27 mars 2009.La priorité étant aussi donnée aux filières courtes professionnalisantes axées sur les nouvelles technologies, l’Université de Ségou devra former en quelques années des cadres compétents pour assurer le développement rapide du pays.